文化庁が発表した最新の『宗教年鑑』（２０２０〔令和２〕年版）によると、「キリスト教系」に分類されている宗教団体の総信者数は１９０万９７５７人で、前年の１９２万１４８４人から０・６%減少した。教会や布教所などの宗教団体数は前年比０・４%減の８５４６、教師数は前年比０・５%減の３万１４５７人で、いずれも微減した。
『宗教年鑑』は、各宗教法人の報告に基づき文化庁が毎年発表しているもの。信者の定義や資格などに違いがあることなどから、信者数については各宗教団体で重複することもある。そのため、全宗教団体の総信者数は１億８３１０万７７７２人と、実人口の約１億２５５７万人（２０２１年１月１日時点、概算値）の約１・４６倍となっている。
調査は宗教法人ベースで行われているため、非法人宗教団体のみを有する包括宗教団体や、非法人単立宗教団体は調査の対象外となっている。また、キリスト教系に分類される宗教団体には、一般にキリスト教界からは「異端」とされている末日聖徒イエス・キリスト教会（モルモン教）や、ものみの塔聖書冊子協会（エホバの証人）、世界平和統一家庭連合（統一協会）なども含まれている。
統計は、各宗教団体を神道系、仏教系、キリスト教系、諸教の４つに分類。信者数が最も多いのは神道系で８８９５万９３４５人。次が仏教系で８４８３万５１１０人、諸教が７４０万３５６０人となっている。神道系は前年の８７２１万９８０８人から２%増。仏教系は前年の８４３３万６５３９人から０・６%増と微増した。諸教は前年の７８５万１５４５人から５・７%減少した。
キリスト教系の信者数を教団別で見ると、最も多いのはカトリック教会で４３万７６０７人（前年比３２８６人減）、２位は日本基督教団で１１万１５８８人（同４９８人増）、３位は日本聖公会で４万７１５０人（同７３６人減）、４位は日本バプテスト連盟で３万３６３６人（同９３人減）、５位は日本福音ルーテル教会で２万１８６９人（同１１人増）だった。
都道府県別で見ると、キリスト教系の信者数が最も多いのは東京都で８６万８４９０人（同９５３人減）、２位は神奈川県で３０万２８４１人（同６８９人減）、３位は大阪府で７万１３５３人（同５３０１人減）だった。一方、最も少なかったのは福井県で２０８５人（同１４９人減）、次が島根県で２６８６人（同２４人減）、続く富山県が２８１３人（同１１３人増）だった。
信者数の多いキリスト教系の教団上位１５位と、キリスト教系信者数の多い都道府県上位１０位、キリスト教系信者数の少ない都道府県上位１０位は次の通り。（ ）内は前年の信者数。
■ 信者数の多いキリスト教系教団上位１５位
- カトリック教会 ４３万７６０７人（４４万８９３人）
- 日本基督教団 １１万１５８８人（１１万１０９０人）
- 日本聖公会 ４万７１５０人（４万７８８６人）
- 日本バプテスト連盟 ３万３６３６人（３万３７２９人）
- 日本福音ルーテル教会 ２万１８６９人（２万１８５８人）
- セブンスデー・アドベンチスト教団 １万４９８８人（１万４９３２人）
- イエス之御霊教会教団 １万４３６０人（１万４５８０人）
- 日本同盟基督教団 １万２６６１人（１万２３４９人）
- 日本アッセンブリーズ・オブ・ゴッド教団 １万１６９５人（１万２２４８人）
- イムマヌエル綜合伝道団 １万１２０１人（１万１２０１人）
- 日本キリスト教会 １万８３４人（１万９４５人）
- 日本キリスト改革派教会 ９７３９人（９７９２人）
- 日本正教会 ９４６８人（９４８５人）
- 日本イエス・キリスト教団 ７４２９人（７５６５人）
- 日本ホーリネス教団 ７２６１人（７３１９人）
※ 末日聖徒イエス・キリスト教会（モルモン教、１２万８１３２人〔１２万７５３５人〕）は除く。
■ キリスト教系信者数の多い都道府県上位１０位
- 東京 ８６万８４９０人（８６万９４４３人）
- 神奈川 ３０万２８４１人（３０万３５３０人）
- 大阪 ７万１３５３人（７万６６５４人）
- 長崎 ６万２９７５人（６万４１７４人）
- 兵庫 ５万７８６７人（５万９００７人）
- 愛知 ４万６９１５人（４万６２００人）
- 福岡 ４万６５８４人（４万６７９１人）
- 北海道 ４万５０５８人（４万５６５５人）
- 埼玉 ３万８９９７人（３万８９９９人）
- 千葉 ３万５８９４人（３万６２０９人）
■ キリスト教系信者数の少ない都道府県上位１０位
- 福井 ２０８５人（２２３４人）
- 島根 ２６８６人（２７１０人）
- 富山 ２８１３人（２７００人）
- 徳島 ３０７３人（３２４２人）
- 鳥取 ３４０３人（３２００人）
- 高知 ３７８０人（３８７５人）
- 佐賀 ４２４３人（４２５４人）
- 岩手 ４２４８人（４２３８人）
- 秋田 ４３１８人（４４６７人）
- 香川 ４６５８人（４７２７人）
※ 都道府県別のランキングでは、『宗教年鑑』の統計上、末日聖徒イエス・キリスト教会（モルモン教）や、ものみの塔聖書冊子協会（エホバの証人）、世界平和統一家庭連合（統一協会）なども「キリスト教系」の信者数に含まれている。